IBM soll Genome Reading kommerzialisieren

IBM ist Partner von Roche, einem Hersteller von Medizinprodukten, um ein kostengünstiges Gerät zu bauen, das menschliche Genome lesen kann, gab das Unternehmen am Donnerstag bekannt.

Obwohl die Technologie vielleicht noch ein Jahrzehnt oder mehr von der Kommerzialisierung entfernt ist, sollte sie nach Abschluss jedem Arzt einen kostengünstigen und schnellen Weg bieten "Ajay Royyuru, leitender Manager der Computational Biology bei IBM Research.

" "Die Kosten der Genom-Sequenzierung ist gesunken, und die Geschwindigkeit hat begonnen, sich zu verbessern, aber es gibt immer noch Probleme mit der Geschwindigkeit, Maßstab, Durchsatz, sowie Kosten ", sagte Royyuru.

Das Projekt wird IBMs" DNA-Transistor "verwenden. Diese Transistoren enthalten Nanoporen oder sehr kleine Poren, durch die jeweils ein Strang von Desoxyribonukleinsäure (DNA) laufen kann. Die Nanopore identifiziert jede Basis der DNA unter Verwendung eines elektrischen Feldes.

Weil die Nanopore teilweise aus Silizium hergestellt ist, sollte sie in der Lage sein, mit den gleichen Lithographietechniken zur Herstellung von Mikroprozessoren in Massenproduktion hergestellt zu werden Kosten, sagte Royyuru.

Während andere Forscher auch die Verwendung von Nanoporen erforscht haben, können solche Entwürfe die DNA nicht genau lesen, weil die DNA zu schnell durch die Pore reist.

"Es ist wie Saugen auf Spaghetti. Einmal DNA beginnt sich durch die Nanopore zu bewegen, es geht sehr schnell. Wir haben gesehen, dass 48.000 Einheiten DNA in 10 oder 20 Millisekunden durchlaufen werden. Bei dieser Geschwindigkeit haben Sie sehr wenig Chance, das korrekt zu lesen ", sagte Royyuru Geschwindigkeit der DNA, hat IBM auf der Nanopore eine elektrische Kontrolle hergestellt, um den Fluss auf die gewünschte Geschwindigkeit zu spannen. "Wir können die Bewegung der DNA durch die Pore elektrisch steuern. Wir können sie Einheit für Einheit voranbringen", sagte er.

Obwohl die DNA-Sequenzierungstechnologien seit Anfang der 1970er Jahre existieren, wurde das gesamte menschliche Genom nicht vollständig entschlüsselt bis 2001, aufgrund des Automaten, der benötigt wird, um die große Anzahl von Basenpaaren zu decodieren, die gelesen werden müssen. Die DNA jeder Person enthält etwa 3 Milliarden Basenpaare von Nukleotiden.

Obwohl sich die DNA-Sequenzierungstechnologie seitdem verbessert hat, kostet es immer noch ein paar hunderttausend Dollar, ein komplettes menschliches Genom zu lesen, sagte Royyuru. Sobald es fertig ist, sollte dieses Gerät in der Lage sein, die Arbeit für irgendwo von US $ 100 bis $ 1.000 pro gelesenem zu leisten, schätzte Royyuru.

Royyuru lehnte ab, eine Zeit anzubieten, als die Maschine im Handel verfügbar sein würde und nannte die vielen Schritte, die benötigt werden, irgendwelche zu holen radikal neue Technologie in der Produktion. Er schätzte, dass es rund fünf bis zehn Jahre dauern würde, bis die Forschung abgeschlossen war.

452 Life Sciences, die Sequenzierungstochter von Roche, wird letztendlich die daraus entstehenden Produkte vermarkten. IBM wird seine Expertise in den Bereichen Elektronik und Datenmanagement in die Partnerschaft einbringen, während Roche sein Wissen in der medizinischen Diagnostik und Genom-Sequenzierung einsetzen wird, sagte Royyuru.

Das Lesen des genetischen Codes einer Person könnte mehrere medizinische Vorteile haben, erklärte Royyuru. Vor allem erlaubt es Ärzten, die Bereitstellung von medizinischer Versorgung zu personalisieren, sagte er. Zum Beispiel werden viele Medikamente bei einigen, aber nicht bei allen Menschen funktionieren. Die DNA einer Person in der Hand hilft einem Arzt, das geeignete Medikament zu verschreiben. Auch das Lesen des Genoms kann die Anfälligkeit für bestimmte Krankheiten zeigen.

Vielleicht könnte eine andere frühe Verwendung darin bestehen, zu bestimmen, wie lange Individuen leben können. Am Donnerstag kündigten Wissenschaftler der Boston University an, dass sie scheinbar genetische Signaturen für Langlebigkeit gefunden haben.

Joab Jackson berichtet über Enterprise Software und allgemeine Technologie, die Neuigkeiten für

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